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朋友的有怎么写怎么组词,转录组文章怎么写能发2区文章?

互联网 2021-03-03 06:44:10

随着测序成本的下降,转录组测序已经逐步成为分子生物学实验的标配,每年有大量的数据产出,这也导致了转录组测序分析的文章越来越难以发表。

今天小编就给大家带来一篇今年10月份见刊的转录组文章,该文章发表在BMC Plant Biology上,影响因子3.93,中科院分区二区;接下来让我们一起来看看别人的转录组是如何发到二区期刊上的!

闲话不多说,直接解读。

1、实验设计很重要,对照处理要有显著的差别。作者将萝卜芽在蒸馏水或者富氢水(HRW)制备的培养基上培养。黑暗条件下培养1天后,分别转移到白光(W)培养箱中和UV-A照明培养箱中培养。在12、24、36小时测定总花青素含量,并在光照处理后测定内源氢气的含量。

2、作者在光处理24小时后取样,液氮冷冻,-80度保存,并提取RNA,用于转录组测序分析。一共4个样品:W+HRW、W、UV-A、UV-A + HRW,两两对比形成差异组合。共鉴定出14564个差异基因。并通过聚类热图、维恩图等来进一步分析了各个差异组合中差异基因的上下调情况。

3、作者通过GO和KEGG注释以及富集,深入的挖掘分析了各个差异组合的差异情况。

4、作者通过分析花青素合成代谢途径,挑选出了12种相关的结构基因以及94种转录因子,并对这些结构基因和转录因子在W和UV-A处理下的基因表达情况进行了分析,构建了表达热图。

5、根据KEGG和GO注释结果,作者也分析了信号转导、MAPK以及钙信号通路的差异基因。

6、作者挑选了16个花青素合成相关的差异基因进行了qRT-PCR验证,结果与转录组测序结果基本一致,说明RNA-seq数据是可靠的。

7、最后,作者结合前人的研究结果和自己的实验数据进行了讨论,并提出在UV-A辐射下HRW能够促进萝卜芽中花青素的积累,并绘制了调控网络图。

就这样,一篇3分多的二区转录组文章就完成了。通篇看来,文章思路清晰,分析简单,没有过多的补充实验,不失为一篇低投入高性价比的转录组测序类文章。这也表明转录组测序类文章并没有想象中的难写难发,只要设计合理,结果可靠,能够自圆其说,发一篇三四分的文章还是很简单的;更多具体信息请下载原文观看吧!

同样做转录组实验,为什么有人可以发二区文章,而有些人却发不出去呢?究其原因无非是以下两个原因:

转录组数据结果似懂非懂,无法做到从海量结果数据里一层一层筛选出关键的研究结果。

转录组标准分析后续分析及实验无思路,无法完成整个科研闭环!

需要文献原文的老师请关注“组学大讲堂”微信公众号,转发该文章至您的朋友圈并截图,然后在公众号对话框内发送截图证明并留言 “萝卜” 即可获得原文献!(注意关键词需写全)。

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